Me ha pasado que al ir a ejecutar un script no me deja.
Una de las razones puede ser debido a que se ha abierto con windows y ha añadido en final de archivo etc.. de msdos.
Para volver a dejarlo todo para ejecutarlo con Linux instalamos la utilidad dos2unix y hacemos sobre el archivo:
# dos2unix nombreArchivo > nombreArchivoNuevo
lo puedes ver en
http://systemadmin.es/2011/02/bin-bash-bad-interpreter
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